Нельзя не отметить значение очагов хронической инфекции, соматических и эндокринных заболеваний (сахарный диабет, ожирение) в возникновении вегетативной дисфункции у детей. Несомненна роль и гормонального дисбаланса. Например, пубертатный период можно рассматривать как своеобразный провоцирующий момент, выявляющий скрытую до того неполноценность центральных регуляторных механизмов. Причинами ВД также могут стать постнатальная черепно-мозговая травма, синдром внутричерепной гипертензии.
Большое значение в формировании ВД имеют экодепрессивные влияния среды. Комплекс неблагополучных экологических факторов приводит к развитию в организме ряда специфических и неспецифических отклонений, к возникновению синдрома адаптационного напряжения При этом ранние проявления неспецифичны и представлены различными вариантами вегетативной дисфункции. Доказано, что малые дозы ионизирующего излучения, как катализатор, ускоряют возникновение и течение патологического процесса.